我國目前增值稅實行的是購買抵扣稅法，即納稅人有應稅行為時，按照銷售額計算銷項稅額，購買商品、服務、無形資產或不動產時，所繳納或承擔的稅額為進項稅額，允許從銷項稅額中抵扣進項稅額。這樣就相當于只對應稅行為的增值部分征稅。當銷項稅額小于進項稅額時，不足的抵扣可結轉下期進一步抵扣。
增值稅一般納稅人適用一般計稅方法的，當期進項稅額扣除當期銷項稅額后的余額為當期應納稅額。
進項稅是指納稅人在購買貨物、加工、修理和更換服務、勞務、無形資產或不動產時所繳納或承擔的增值稅。
例如，一個從事建筑服務的增值稅一般納稅人于2016年6月10日購買了建筑材料，增值稅專用發票上注明的稅額為100萬，那么100萬就是該納稅人當前的進項稅額。
允許從銷項稅中扣除哪個進項稅？
答:下列進項稅允許從銷項稅中扣除:
1.從賣方取得的增值稅專用發票上注明的增值稅(包括機動車銷售稅控統一發票)。
2.從海關取得的《海關進口增值稅專用繳款書》注明的增值稅。
3.所有采購的農產品均已取得《增值稅專用發票》或《海關進口增值稅專用繳款書》，可按注明的增值稅抵扣。未全部獲得的，按照《農產品增值稅進項稅額核定抵扣辦法》抵扣。
4.向境外單位或個人購買勞務、無形資產或不動產時，從稅務機關或扣繳義務人取得的完稅證明上注明的增值稅。
提示:增值稅發票抵扣需要當月認證或檢查。認證一致或勾選的，應在次月申報期申報扣除，否則不予扣除。海關進口增值稅專用繳款書需要“比對后抵扣”。審計比較結果一致的，應當在審計比較一致的月份的報告期內申報扣除，否則不予扣除。
增值稅專用發票應當自開具之日起180日內核驗，海關進口增值稅專用繳款書應當自開具之日起180日內審核比對。超過期限的不予扣除。
舉例:某增值稅一般納稅人于2016年6月取得增值稅專用發票，發票注明金額為人民幣100萬元，稅額為人民幣6萬元，當月在增值稅發票查詢平臺進行了核對確認。納稅人應在7月申報期內申報抵扣進項稅額6萬元。會計處理如下:
借:相關科目1000000
應交稅金-應交增值稅(進項稅)60000
貸款:銀行存款:1060000
扣除方法
(1)增值稅專用發票的抵扣方式是什么？
答:增值稅發票可以通過增值稅發票查詢平臺查詢、網上掃描認證、稅務服務大廳掃描認證等方式抵扣。2016年5月至7月，本次營改增試點增值稅一般納稅人無需進行增值稅發票認證，而是選擇通過增值稅發票查詢平臺確認抵扣的增值稅發票信息。
(2)海關進口增值稅繳款書的抵扣方式是什么？
答:海關進口增值稅繳款書通過海關繳款書數據采集比對結果接收平臺進行核對比對。對比一致后，增值稅金額可以作為進項稅從銷項稅額中扣除。
(3)農產品的抵扣方式是什么？
答:增值稅一般納稅人購買農產品時，取得全部或部分農產品購買發票或普通發票。此類納稅人取得農產品增值稅專用發票和海關進口增值稅專用繳款書，按照《農產品增值稅進項稅額核定抵扣試行辦法》規定的方法計算抵扣進項稅額。