在《企業會計制度》下，增值稅反映在“應交稅金”科目中；《企業會計準則》將“應納稅”科目改為“應納稅”科目，以下不作特別區分。無論執行什么會計制度，完整規范的增值稅會計制度中的明細科目設置和核算情況基本相同，如下:
1.“應交稅金”由“應交增值稅”和“未付增值稅”明細科目組成；
二、“應交增值稅”科目核算本期應交增值稅，指銷項稅額與進項稅額的差額，一般余額在借方。“未付增值稅”是指貸方反映企業本期未付金額，借方反映本期已付或多付金額。
3.在應付增值稅項下，設置進項稅、轉出進項稅、銷項稅、已付稅、減免稅、出口退稅(適用于出口企業)、出口扣除國內產品應納稅額(適用于出口企業)、增值稅檢查和調整、轉出未付增值稅
四.應交增值稅=銷項稅額-(進項稅額-進項稅額的轉移)-出口扣除國內產品應納稅額-減免稅+出口退稅
1.“進項稅”明細科目核算本期可抵扣的所有增值稅進項稅，主要包括購買商品、接受勞務、運輸費用支付價款中的增值稅。計算方法為:當期進項稅額=當期購買的商品或接受的服務金額*抵扣稅率，扣除運輸費7%。會計期間借記“應交稅金-應交增值稅-進項稅”
2.“進項稅轉出”明細科目主要核算由于企業采購的貨物、在產品、產成品發生非正常損失，以及采購的貨物因用途變更而無法再抵扣，而轉出“進項稅”已入賬部分的金額。簡單來說就是勾掉不能扣的金額。在會計期間貸記“應交稅金-應交增值稅(轉出進項稅)”。
3.“銷項稅”明細科目核算企業銷售商品和提供應稅勞務應繳納的全部增值稅銷項稅。計算方法為:當期銷項稅額=當期應納稅銷售額*增值稅率(或征收率)，金額貸記。
4、“應交稅金”核算企業已繳納的當期增值稅。上繳時，借記“應交稅金——增值稅(已繳稅)”科目，貸記“銀行存款”科目。
5.“減免稅”反映的是企業直接減免稅的增值稅。
6、出口企業應設置“出口退稅”、“國內產品出口扣稅”明細科目。
7.“轉出未繳增值稅”是指企業當期應繳納的未繳增值稅。核算時，借記“應交稅金-應交增值稅(轉出未交增值稅)”科目，貸記“應交稅金-未交增值稅”。借款人反映本期應納稅額，貸款人反映本期已繳納的前期應納稅額，以及前期已繳納的增值稅可以抵扣的稅款。
8.“轉出多付增值稅”反映企業多付。月末，將多付的增值稅轉入“未付增值稅”借方，借“應交稅金-未付增值稅”，借“應交稅金-應交增值稅”。
9.“檢查和調整應繳納的增值稅”。經檢查，從賬面進項稅或銷項稅轉出的金額應減/增，相關科目應借記本科目，貸記本科目；凡檢查后應增加賬面進項稅或減少銷項稅的，借記本科目，貸記相關科目；賬戶調整項目全部入賬后，應對該賬戶余額進行結算和處理。
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